Tumbuhan paku memiliki manfaat yang cukup banyak, diantaranya adalah:
- Sebagai salah satu sumber fosil batu bara yang bermanfaat untuk bahan bakar
- Sebagai tanaman hias, yaitu: suplir (Adiantum cuneatum), paku sarang burung (Asplenium nidus), paku tanduk rusa (Platycerium bifurcatum) dan pakis (Nephrolepis sp.)
- Sebagai bahan penggosok untuk mencuci bahan dari gelas, yaitu: paku ekor kuda (Equisetum debille)
- Sebagai bahan baku obat-obatan, yaitu species Dyopteris filix-mas (paku picisan) dan Lycopodium clavatum
- Sebagai bahan makanan, yaitu semanggi (Marsilea crenata) dan berbagai jenis tumbuhan paku yang daunnya masih muda (pakis)
- Sebagai media tumbuh tumbuhan anggrek, yaitu paku tiang (Alsophilla glauca)
- Sebagai pupuk hijau, yaitu Azolla pinnata yang hidup bersama dengan Annabaena azollae(kelompok ganggang biru). Annabaena azollae mengikat unsur nitrogen yang ada di udara bebas menjadi senyawa nitrogen yang yang dapat diserap oleh tumbuhan lain sehingga dapat menyuburkan tanah
